A Microbiologia abrange  diversos ramos,e dentre deles destaca-se  a  Microbiologia Médica (Microbiologia Clínica) .

A Microbiologia Médica estuda os principais agentes microbianos causadores de doenças infecto-contagiosas em humanos. Destacando-se os aspectos de diagnóstico clínico laboratorial, patogênicos e epidemiológicos.

O objetivo também da microbiologia médica, não é apenas apontar o responsável por um determinado estado infeccioso, mas sim, indicar, através do monitoramento de populações microbianas, qual o perfil dos microrganismos que estão interagindo com o homem. Com essas informações, a equipe de 

saúde é capaz de definir quais microrganismos podem ser responsáveis pelo quadro clínico do 

paciente e assim, propor um tratamento mais adequado. No entanto, para alcançar esses objetivos,

os laboratórios de microbiologia devem possuir estrutura capaz de estabelecer informações sobre a 

melhor amostra biológica, reconhecer a flora normal, reconhecer os contaminantes, identificar 

microrganismos cujo tratamento beneficia o paciente, identificar microrganismos com propósitos 

epidemiológicos, obter resultados rápidos em casos de emergência, racionalizar no uso de 

antimicrobianos, realizar o transporte rápido das amostras e o relato dos resultados e manter uma 

educação médica contínua em relação aos aspectos da infecção.